No dia do assalto, Jonathan estava na companhia de outro suspeito, identificado como Philipte Landes e, juntos, abordaram os clientes do estabelecimento, ameaçando-os com arma de fogo. Os dois, no entanto, foram surpreendidos por dois policiais militares que estavam na lanchonete.
Para não ser preso, Philipte reagiu disparando contra um dos policiais militares, atingindo-o na mão e no braço. O mesmo policial conseguiu também atirar contra Philipte, que chegou a ser encaminhado a um hospital, mas não resistiu aos ferimentos e morreu.
Jonathan conseguiu fugir no dia da troca de tiros. Com base em informações fornecidas por testemunhas que o reconheceram posteriormente, os policiais civis conseguiram localizá-lo e prendê-lo. Ele foi encaminhado ao Centro de Remanejamento do Sistema Prisional (Ceresp) da Gameleira, Região Oeste da capital..