Os trabalhadores, um rapaz de 18 anos e uma garota de 19, morreram na madrugada de domingo quando limpavam a cozinha do local no distrito de Pueblo Libre.
"Estamos investigando o caso. Um grupo de especialistas em criminalística está (agora) no local para verificar a situação", disse à AFP uma fonte da Direção de Criminalística da polícia.
As vítimas são Carlos Campos e Alexandra Porras, que concluíram recentemente o Ensino Médio e trabalhavam no turno da noite há seis meses naquele estabelecimento.
Segundo a polícia, a menina sofreu a descarga elétrica enquanto manuseava uma máquina de refrigerante. Seu colega tentou ajudá-la, mas também foi atingido pela descarga.
A empresa operadora do McDonald's no Peru lamentou o ocorrido e anunciou uma investigação a respeito.