Os donos da casa abriram o placar aos 21 minutos por meio do zagueiro Leonard Costa.
Os atacantes Mathías Acuña (55) e Emiliano Gómez (64) ampliaram no segundo tempo e César Magallán descontou para os visitantes (75).
A partida foi disputada em um Estádio Centenário deserto. Entre os poucos presentes estava o presidente do Uruguai, Luis Lacalle Pou, torcedor confesso do Boston River.
A partida de volta será disputada na próxima quinta-feira, no estádio Agustín Tovar, na cidade venezuelana de Barinas e o vencedor do confronto vai enfrentar o argentino Huracán na segunda fase.