O acidente aconteceu depois que um dos trens de passageiros desrespeitou a sinalização entre as cidades de Alamanda e Kantakapalle, no estado de Andhra Pradesh.
Uma investigação preliminar aponta "falha humana" no acidente, informou o Ministério das Ferrovias.
"Treze passageiros morreram e quase 50 ficaram feridos. As operações de resgate continuam", declarou Nagalakshmi S., funcionário do governo local.
O balanço inicial registrava oito mortes.
O premiê indiano, Narendra Modi, escreveu no X (antigo Twitter), que falou com o ministro de Ferrovias e que "envia suas condolências às famílias enlutadas e reza pela pronta recuperação dos feridos".
A Índia tem uma das maiores redes ferroviárias do mundo e sofreu vários acidentes ao longo dos anos. O pior foi em 1981, quando um trem descarrilou ao cruzar uma ponte no estado de Bihar e caiu no rio, deixando 800 mortos.