O tcheco Vaclav Cerny colocou o Wolfsburg na frente aos 14 minutos e o placar não mudou mais.
O Leipzig acabou com dez homens em campo devido à expulsão do dinamarquês Yussuf Poulsen no início do segundo tempo (56').
Este revés priva o Leipzig, atualmente em quinto lugar na Bundesliga, de poder lutar pelo terceiro título consecutivo da Copa.
O Wolfsburg, nono colocado do Campeonato Alemão depois de sofrer quatro derrotas nos últimos cinco jogos, chega assim às oitavas de final. Desde o título em 2015, o time não consegue passar das quartas de final desta competição, que seu técnico Niko Kovac já conquistou em 2018, quando comandava o Eintracht Frankfurt.
Nos demais jogos do dia, o Stuttgart, uma das surpresas do início da temporada na Alemanha, avançou às oitavas ao vencer por 1 a 0 o Union Berlin, equipe da 'Champions' mas que nesta temporada está na parte inferior da tabela.
Deniz Undav marcou o único gol do Stuttgart nessa partida.
Em outro duelo entre times da primeira divisão, o Borussia Mönchengladbach venceu o Heidenheim por 3 a 1, com uma dobradinha do americano Jordan Siebatcheu logo nos primeiros dez minutos de jogo.
Já o Greuther Fürth, da segunda divisão, foi surpreendido por 2 a 1 pelo Homburg, da quarta.
Na quarta-feira, Bayer Leverkusen e Bayern de Munique, respectivamente primeiro e segundo colocados da Bundesliga, viajam para enfrentar dois times da terceira divisão, Sandhausen e Saarbrücken.
--- Resultados da segunda rodada da Copa da Alemanha:
- Terça-feira:
(+) St Pauli (2ª) - Schalke 04 (2ª) 2 - 1 (após prorrogação)
(+) FC 08 Homburg (4ª) - Fürth (2ª) 2 - 1
(+) Stuttgart (1ª) - Union Berlin (1ª) 1 - 0
(+) Wolfsburg (1ª) - RB Leipzig (1ª) 1 - 0
SpVgg Unterhaching (3ª) - (+) Fortuna Dusseldorf (2ª) 3 - 6
Bielefeld (3ª) - (+) Hamburgo (2ª) 1 - 1 (3-4 nos pênaltis)
(+) Borussia Mönchengladbach (1ª) - Heidenheim (1ª) 3 - 1
(+) Kaiserslautern (2ª) - Colonia (1ª) 3 - 2
- Quarta-feira:
(14h00) Sandhausen (3ª) - Bayer Leverkusen (1ª)
Kiel (2ª) - Magdeburg (2ª)
Freiburg (1ª) - Paderborn (2ª)
Borussia Dortmund (1ª) - Hoffenheim (1ª)
(16h45) Viktoria Colonia (3ª) - Eintracht Frankfurt (1ª)
Nuremberg (2ª) - Rostock (2ª)
Sarrebruck (3ª) - Bayern de Munique (1ª)
Hertha Berlim (2ª) - Mainz (1ª)
(+): classificados para a próxima fase