De acordo com o delegado seccional de Sorocaba, Marcelo Carriel, os antigos diretores usavam o setor financeiro do hospital como se fosse seu banco privado. O relatório mostra que o caixa era usado para trocar cheques de diretores e de terceiros, financiar compras de particulares e até para empréstimos. Apenas uma funcionária tomou 17 empréstimos que somaram R$ 45 mil e não os pagou. Também é apontado desvio de parte de uma verba de R$ 5 milhões destinada à construção de um centro de oncologia.
O relatório e a documentação enviados pela auditoria passarão por perícia contábil da Polícia Civil. O delegado vai pedir a quebra dos sigilos bancário e fiscal e a avaliação da evolução patrimonial dos ex-diretores. A suspeita é de que os desvios de recursos podem ter prejudicado o atendimento à população.
As irregularidades na Santa Casa de Sorocaba, também são alvo de uma Comissão Parlamentar de Inquérito (CPI) criada pela Câmara. De acordo com o vereador José Crespo (DEM), que preside a apuração, o plano é trabalhar em conjunto com a Polícia Civil e o Ministério Público para chegar aos responsáveis pela má gestão do hospital e obter o ressarcimento dos prejuízos. O ex-provedor, José Antonio Fasiaben, informou que só vai se manifestar depois de ter acesso ao conteúdo da auditoria, o que está sendo providenciado pelos seus advogados.
Fundada em 1803 para atender pobres e necessitados, a Santa Casa de Sorocaba pertence a uma Irmandade de caráter filantrópico, mas está sob a gestão da prefeitura desde janeiro de 2014. O município assumiu o hospital por decreto, depois que uma auditoria preliminar constatou indícios de mau uso dos repasses de verba pública - o hospital recebia R$ 5 milhões ao mês, sendo R$ 2 milhões da prefeitura e R$ 3 milhões do governo federal, através do SUS. Desde então uma comissão gestora de emergência administra o hospital..