O índice mostra a média dos conceitos dos cursos de graduação e pós-graduação das instituições de ensino no triênio, com base no desempenho dos estudantes do Exame Nacional de Desempenho de Estudantes (Enade) e notas da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (Capes).
Já entre as universidades paulistas, as médias registradas em 2012 se mantiveram - nenhuma teve nota abaixo de 3, ou seja, tiveram desempenho suficiente. A única instituição a melhorar foi a Universidade do Oeste Paulista, em Presidente Prudente, que subiu o IGC de 3 para 4. As instituições melhores avaliadas no Estado, com nota 5, foram as seguintes: Universidade Federal do ABC (UFABC), Universidade Federal de São Paulo (Unifesp) e Universidade Estadual de Campinas (Unicamp). A Universidade de São Paulo (USP) não entra na avaliação, já que, até 2012, não participava do Enade..