A igreja foi arrombada duas vezes em uma semana e os ladrões levaram castiçais, vasos, uma televisão, um ventilador, dinheiro da caixa coletora, 30 camisas do Senhor Bom Jesus dos Passos e até hóstias.
A primeira invasão, seguida de furto, ocorreu na madrugada de domingo (14). O sacrário foi arrombado e as hóstias foram levadas em duas âmbulas, um tipo de cálice onde elas são colocadas para serem consagradas.
Por causa da invasão, foi marcada a missa com ato de desagravo e registrado um boletim de ocorrência na 1ª Delegacia Territorial da cidade.
No entanto, a cerimônia com o desagravo foi desmarcada após o segundo arrombamento, na madrugada de quinta (18). Na segunda invasão foram levados televisão, ventilador e dinheiro (o valor não foi informado).
Um novo boletim de ocorrência foi registrado e a Polícia Civil investiga os dois casos.
A Arquidiocese de Salvador informou que a missa com ato de desagravo será realizada em outra ocasião.
A igreja fica próxima à praça da Sé, no centro histórico de Salvador, e sediou pregações dos padres Anchieta, Antônio Vieira e Manuel da Nóbrega.
A primeira igreja no local foi uma construção pioneira dos jesuítas, em 1549, no Brasil. Foi também a igreja que abrigou o primeiro bispo do pais, Dom Pedro Fernandes Sardinha.
O prédio original foi demolido em 1912, como parte de um processo de remodelação de Salvador. Uma nova igreja foi inaugurada em 1923, durante as festas o centenário da independência do Brasil.