Na ocasião, ele alegou que essas organizações “são importantes e desempenham suas funções com uma flexibilidade que a administração direta não permite, sem, contudo, desrespeitar a coisa pública”. Atualmente, o Ministério de Ciência e Tecnologia tem cinco unidades de pesquisa administradas por organizações sociais.
Em 2007, o STF rejeitou pedido de liminar para que os convênios fossem considerados irregulares. Hoje à tarde, os ministros devem definir a questão de forma definitiva. A Advocacia-Geral da União (AGU) manifestou-se favorável à lei. Já a Procuradoria-Geral da República (PGR) deu parecer pela declaração de inconstitucionalidade de todas as interpretações que pretendam reduzir a atividade dos órgãos de controle. Dentre os 11 ministros do Supremo, somente 10 devem participar do julgamento, já que Dias Toffoli está impedido por ter atuado no caso quando comandava a AGU. O relator do processo é o ministro Carlos Ayres Britto.