A PF afirmou, por meio da assessoria, que o inquérito só foi instaurado agora devido ao envio, em janeiro deste ano, de documentos do Ministério Público Federal que complementaram as informações do ofício do deputado tucano. Conforme a PF, apenas com o documento do deputado, que incluía material jornalístico, não era possível instaurar um inquérito.
As investigações, nos dois casos, serão feitas pela PF em Brasília, em parceira com o procurador do Ministério Público Federal do Rio de Janeiro Orlando Espíndola, que já apura a compra da refinaria. As denúncias já eram alvos de apuração, há vários meses, do Tribunal de Contas da União (TCU) e da Controladoria Geral da União (CGU). "A PF tomou a iniciativa para não ficar a reboque das investigações no Congresso e do TCU. O governo terá agora o controle do fluxo das informações que irão circular em torno do assunto para não tomar bola nas costas", criticou o líder do DEM na Câmara, deputado Mendonça Filho (PE).
A Petrobras pagou, em 2006, US$ 360 milhões por 50% da refinaria no Texas. Um ano antes, a trading belga Astra/Transcor havia comprado a mesma planta de refino por US$ 42,5 milhões. Após uma briga judicial com a trading, a estatal pagou mais US$ 820 milhões para encerrar o litígio e adquirir o restante da participação. "Há grande probabilidade de que o acordo (compra de Pasadena) tenha sido prejudicial à companhia brasileira, com possíveis prejuízos da ordem de US$ 1 bilhão", justificou Imbassahy no ofício enviado ao ministro Cardozo, acrescentando haver indícios de "gestão temerária, desvios de recursos públicos e lavagem de dinheiro."
A denúncia sobre a SBM partiu de um ex-executivo da empresa. Segundo ele relatou no site Wikipedia, funcionários da Petrobras receberam dinheiro para fechar negócios com a empresa, que aluga navios-plataforma. A Petrobras não se manifesta sobre os inquéritos. A oposição montou uma estrutura de CPI para investigar a Petrobras aproveitando a fase oposicionista do PMDB, contrariado com a reforma ministerial do governo e em disputa com o PT por alianças políticas nas eleições deste ano.