O esquema de segurança será o mesmo utilizado no primeiro turno e contará com toda a tecnologia e aparato de segurança pública utilizado na Copa do Mundo. Para garantir a segurança durante todo o dia, atuarão 3.500 policiais militares, sendo 1.564 policiais militares, 990 policiais civis, 122 policiais federais; 200 bombeiros militares; 70 agentes de trânsito de Cuiabá; oito policiais rodoviários federais e 18 guardas municipais de Várzea Grande.
Cerca de 500 militares do Exército Brasileiro vão operar com foco nos locais de votação indígena. Serão, no mínimo, nove militares distribuídos em 21 sessões localizadas em áreas indígenas. Mato Grosso tem mais de 2 milhões de eleitores em 1.481 locais de votação. A segurança dos eleitores também será feita por meio de aviões e barcos. Para garantir a logística, serão utilizados 1.928 veículos, entre carros, caminhões e motos, conforme o TRE-MT..